研究論文中的研究方法一節說明了您是如何進行研究的，這類資訊讓您的讀者得以評判您的發現是否具有效度，如果他們想要複製或修改您的實驗時，也有所參照。為了幫助讀者找到他們想要的資訊，研究方法一節需要有清楚的架構且包含相關細節。以下將解釋如何架構研究方法一節，讓方法論資訊能簡單取得。

研究方法一節的含括內容應該包括下列資訊：

• 研究設計
• 究的標的（動物模型、人類受試者、細胞等）
• 使用的東西（設備材料，附上製造商細節）
• 測量的東西（成果測量變項）
• 如何收集數據
• 如何分析數據

如果您將這些資訊分小節安排再加上副標題，讀者將能更容易地找到自己要的東西。首先，從研究設計的描述開始，這樣比較符合常理，因為前言通常會以實驗方法的簡短描述做結。收尾時，以數據分析方式的描述做結，能有效地轉換至結果一節。

檢視您所選的目標期刊的作者指南，去獲取架構研究方法的明確說明。有部分期刊要求作者遵守「報告指南（Reporting guidelines）」，這些指南要求詳細的研究類型，可增進您論文的品質，確保所有相關資訊都包括在內。

現在，我們來仔細看看各小節應該包含的內容。

研究設計

首先，簡短敘述您的研究設計。對臨床試驗來說，敘述「試驗的類型」，如平行、交叉、因素分析和「假設」，即明確指出您尋找的是優越性、不劣性或等效性等是必要的。如果您在試驗的是新藥，則點明試驗的階段，即第一期至第四期。以動物研究來說，要描述比較的族群，如野生型小鼠相較於基因修正小鼠。如果研究中未納入對照組，則要解釋原因。例如，比較藥物的口服和腹腔注射時，可能不需要未處理過的對照組。要強化研究完整性，應描述各實驗中使用的組別。這樣才能讓您的讀者知道，您並不是為了要排除預期外的結果而刻意不設計某些組別。

您的讀者會想要判斷您的結果是否有受到偏誤的影響，因此，描述您隨機分配動物或人類受試者至各組的方式，以及，研究者是否在研究組別分配中保持盲性等等，這些將有助您的讀者判斷所報告的成效是否過於高估。

研究對象

動物

動物試驗中，盡可能提供物種名、品系、性別、重量、動物年齡。闡明您何時測量動物體重（製造一個基準值），因為體重可能會在研究過程中有所變化。對大多物種來說，以週數計算年齡比單純指稱發展階段來得具體與數據化。例如，小鼠在約五週時達到性成熟，約六個月時開始受到衰老影響。這個年齡區間很廣，所以論文裡單單說「成年」小鼠對讀者沒有幫助，並都不具體。

人類受試者

以人類受試者進行試驗時，要清楚描述收案標準，讓讀者知道您的論文結果能應用到哪一些族群，以及您的發現與讀者自身的臨床實務有多大的相關性。報告您如何招募受試者、是否獲得受試者的知情同意書等。如果是不需要知情同意書的情況，請說明白，解釋原因。

倫理核可

包含動物和人類受試者的研究通常需要倫理核可。指出批准您的論文倫理核可的是誰，提供核可編碼。

樣本數

告訴讀者計算樣本大小的方法，描述您使用的計算方法，及以此基礎計算出的主要結果。這個資訊相當重要，能凸顯出您的研究找到臨床或科學性重要差異的機率。動物研究中，這個數據也能顯示您沒有使用多於必要數量的動物。提供您在各組和各實驗中納入的動物數量，將能幫助讀者評估您的結果效度。

研究設定

告訴您的讀者數據是從何處收集得來的。在臨床試驗中，描述您的受試者在什麼情境下接受試驗，提供診所的類型、特定地點、機構名稱。這些細節將有助讀者決定您的發現是否也能應用於他們的臨床場域。在動物研究中，描述實驗執行的地點，如在實驗室中、動物設施、開放空間、飼養寵內等，包含適應期。如果包含許多場域時，則需要明確指出實驗執行的地點。

介入或實驗程序

在臨床試驗中，要描述各組別研究的介入措施，包括對照介入。讓您的讀者能夠在自己的臨床設定下複製您所描述的介入。例如，如果您將藥物施予受試者，要提供讀者藥名和劑量，以及告知藥物施予的方式。提供試驗執行的準確日期，明確給出所研究的疾病或症狀，以及如何定義該疾病或疾狀的方法。

在使用動物模型的研究中，解釋您如何發展自己特定模型的方法（如藥物治療、手術過程、病原感染）、您用來測量結果的方法（行為測試或測量動物的生物參數）、相關實驗後程序（如安樂死和組織收集）。另外，詳述動物照顧和處理的過程，因為這些資訊皆會影響結果。

將研究中使用的所有器材細節完整呈現出來，其中包括製造商的詳細資訊。如果可能的話，提供研究資源識別碼（RRID），這樣的編碼比目錄碼有幫助，因為單一產品都有不變的獨特編碼。您在研究中提供的目錄碼的效力建議不要超過三年，否則讀者將無法找到該產品。造訪RRID的網站，為常見的研究資源獲取RRID的完整列表。

成果測量變項

成果測量變項是測量特定介入效果的變項。研究通常有許多成果測量變項，分為主要和次要成果。主要成果是最重要的，用於計算樣本數。次要成果較沒這麼重要，但仍與評估介入的影響有關，有參考價值。清楚定義您的主要和次要成果，提供您評估這些成果的方法和時間。您應該提供足夠的資訊，讓您的讀者能研究在其臨床和實驗設定下的成果。

確切告訴讀者您測量了什麼。例如，在空間學習的研究中，成果測量變項可能是在Morris水迷宮中小鼠尋找水面下平台的能力。您測量了小鼠要花多少時間才能找到水下的平台嗎？小鼠要移動多長的距離才能找到平台？諸如此類。

統計分析

描述您在各實驗中使用的統計方法，讓讀者能評估該分析您的結論是否適切。包含成果測量變項、獨立變項及您使用了哪些測試。解釋如何處理任何缺失的數據，您又是如何調整多重比較的，再介紹您用於分析的軟體是什麼。

檢視細節

研究方法一節的目的是讓讀者足以複製您的實驗和介入的資訊。不要為了符合期刊的字數限制，省去重要的細節，反而應該加上其他的資訊做為補充，或是可以引導讀者去閱讀有更完整描述該方法的文獻，這時要確保引用精簡正確。常見的錯誤是介紹了一篇文獻，而該文獻又要讀者去讀另一篇文獻，所以研究方法論的資訊必須能簡單取得，不需要轉很多個彎。

研究誠信

研究方法是研究論文中重要的一節，可以讓讀者得以複製實驗的手法和驗證論文的發現。這對學術研究的透明性和誠信至關重要。遵從本文所列出的各點項及各式報告指南的要求，將有助您撰寫清楚富有意涵的研究方法章節，進而提升您的研究論文品質。